国家发展改革委高技术产业司于2006年将该项目列入国家高技术产业发展项目计划及国家资金补助计划，针对我国微生物发酵药物开发方面的薄弱环节，提高新药筛选和研发的自主创新能力。项目新增仪器设备124台（套），建设了微生物发酵药物研发平台，菌种大规模分离、选育和保存试验室、新药高通量筛选和活性化合物分离实验室、药物制剂研究实验室、合成药物试验室等。通过项目实施，在医药企业中建成了微生物菌种资源库，先后筛选发现了50余个微生物来源的新结构活性化合物，提高了企业微生物发酵来源的新药筛选和新产品研发能力。