大会的另一个重要议题是制定合理使用药用植物和微生物等遗传资源计划，也就是说在利用植物和微生物等遗传资源时，将利润公平地分配给原产国。本次大会为此将推动制定一个国际协议。

在开幕式上，大会主席、日本环境大臣松本龙呼吁各缔约方努力确保会议获得成功。他指出，虽然在2002年的联大会议上，各国领导人制定了在2010年前使生物多样性损失速度显著减慢的目标，但是根据今年5月公布的第三次全球生物多样性概况调查报告，这一目标显然没有实现。而且，现在已经临近生物多样性丧失趋势无法再扭转的拐点，如果再不积极做出努力，下一个10年很可能越过这个拐点。

松本龙说，自然环境一旦被破坏，就无法恢复，必须使人类的未来能够与自然共生。他希望所有缔约方能就一个积极、现实的全球目标达成一致，在这个目标下，努力保护生物多样性。

《生物多样性公约》秘书处执行秘书艾哈迈德·乔格拉夫在致辞中指出，很多报告显示，生物多样性正以惊人的速度丧失，人类活动的影响与此有关。这种现象不是在几个世纪而是在几十年时间里出现的。如果继续按部就班，生物多样性将遭受无法挽回的损失。他呼吁各缔约方拿出勇气，采取挽救措施。

此次大会的具体议程是确立在2020年前阻止生物灭绝的数据目标，同时审议《名古屋议定书》，以期对发达国家利用原产于发展中国家的动植物和微生物开发医药产品后如何分配利润作出规定。目前，对于如何界定这种利润的形成要素和利润分配范围，发达国家与发展中国家间出现激烈争论。

《生物多样性公约》是一项保护地球生物资源的国际性公约，于1992年6月在巴西里约热内卢由各国签署。该公约具有法律约束力，旨在保护濒临灭绝的动植物和地球上多种多样的生物资源。